Expertise en détail

Toutes nos expertises s’appliquent à des systèmes d’origine agronomique, au sens large : plantes terrestres ou marines, tissus ou organes de plantes, matrices alimentaires ou aliments, matériaux agro-sourcés, systèmes modèles, etc.

Sommaire de navigation :

• Identification & quantification de biopolymères
• Structure fine des polysaccharides complexes et des protéines
• Phénotypage chimique
• Imagerie multimodale et multi-échelle
• Dynamique moléculaire et interactions

Identification & quantification de biopolymères (poly/oligosaccharides, peptides/protéines)

• Aider à caractériser la composition de la matière première, brute ou transformée
• Déterminer l’impact de traitements/procédés ou de facteurs environnementaux sur les structures.

Nos méthodes permettent :

• de déterminer les teneurs en poly/oligosaccharides, sucres solubles & protéines – Equipements privilégiés : GC, HPAEC-PAD, analyse élémentaire
• de caractériser la composition des biopolymères en mélange - Equipements privilégiés : RMN (solide & liquide)

Structure fine des polysaccharides complexes et des protéines

• Apporter des éléments aidant à relier structures présentes et propriétés/fonctionnalités

Sur les poly/oligosaccharides, BIBS propose un ensemble complémentaire et performant de méthodes pour déterminer :

• le profil structural de polysaccharides d'intérêt (empreintes enzymatiques) - Equipements privilégiés : MALDI MS, HPAEC-PAD, UPLC-MS
• l’hétérogénéité structurale plus en détails : modifications, branchements, isoméries, etc. – Equipements privilégiés : UPLC-MS/DEDL, UPLC-MS/MS, RMN liquide
• l’enchaînement des monomères osidiques et leur connectivité (liaisons inter-oses) - Equipements privilégiés : RMN et RMN 2D (solide ou liquide), GC-MS, (UPLC-)MS/MS
• la présence d'isomères - Equipements privilégiés : UPLC-MS/DEDL, UPLC-MS/MS, Mobilité ionique
• le polymorphisme & la cristallinité de la cellulose – Equipements privilégiés : RMN solide

Sur les protéines, nos méthodes permettent : 

• de réaliser des identifications des protéines et leurs modifications à l'échelle d'un protéome - Equipements privilégiés : nanoUPLC-MS/MS (logiciel SpecOMS)

Phénotypage chimique

• Explorer la variabilité compositionnelle et structurale (naturelle ou induite) des polysaccharides, par des méthodes de criblage biochimique à moyen débit

Nos méthodes permettent :

• d'automatiser les étapes d'extraction et de préparation biochimique des échantillons - Equipements privilégiés : extracteurs ASE, automate de préparation 
• d'analyser sur des collections d'échantillons la composition et le profil global des poly/oligosaccharides- Equipements privilégiés : GC, GC-MS, MALDI MS
• de réaliser un traitement chimiométrique des données 

Imagerie multimodale et multi-échelle

• Observer et décrire les structures et architectures à différentes échelles, en lien avec les propriétés/fonctionnalités 
• Apporter des informations chimiques et structurales localisées
• Coupler plusieurs modalités d'imagerie pour obtenir des informations différentes et complémentaires

BIBS propose un vaste ensemble de méthodes complémentaires, en échelle et en information, pour l'imagerie : plusieurs microscopies (électronique à transmission et balayage, à force atomique, fluorescente), de l'imagerie par spectrométrie de masse et de la micro-imagerie par par RMN

Nos méthodes permettent :

• de préparer les échantillons : coupe (vibratome, microtome, cryotome), cryo-substitution, marquage chimique et immuno-cytochimique (protéines & polysaccharides), application d’enzymes in situ
• de décrire (taille, distribution, hétérogénéités) les structures d'un tissu/objet à l'échelle nanométrique - Equipements privilégiés : MET, MEB, AFM
• de coupler une information chimique/moléculaire (identité des biopolymères) localisée, à l'échelle tissulaire ou cellulaire - Equipements privilégiés : AFM-Raman, microscopie confocale, imagerie par spectrométrie de masse MALDI
• de coupler une information localisée de densité et de mobilité de l'eau, à l'échelle tissulaire - Equipements privilégiés : micro-imagerie par RMN
• de fusionner l'information obtenue dans des images multimodales et/ou multi-échelles
• de réaliser des traitements paramétriques des images : quantification, morphologies 

Dynamique moléculaire et interactions

• Observer et décrire les interfaces (eau/air, protéines/lipides, ...) - Equipements privilégiés : MET, MEB, microscopie confocale 
• Mesurer les dynamiques moléculaires : mobilité et diffusion (eau et petits solutés) - Equipements privilégiés : RMN (solide, liquide) (relaxométrie)   
• Caractériser des interactions moléculaires- Equipements privilégiés : microscopie confocale (F-techniques), RMN